СКУБЕНКО
Возможная основа прозвище Скуба, Скубач. восходящее или к скубать, пск. — драть за волосы, смоленск. прясть, или скубиться чесаться. (Даль) Сама форма с суффиксом -енко характерна для Украины.
Источник:
Словарь русских фамилий
на Gufo.me